61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1951 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  93.17 
 
 
387 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  51.99 
 
 
373 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  54.23 
 
 
375 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  50.55 
 
 
376 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  42.82 
 
 
404 aa  316  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  45.38 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  42.17 
 
 
396 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  41.87 
 
 
409 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  39.78 
 
 
393 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  41.36 
 
 
375 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  40.86 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  41.36 
 
 
375 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  40.57 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  40.57 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  40.57 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  40.57 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  40.57 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  38.86 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  37.37 
 
 
373 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  38.4 
 
 
385 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  36.12 
 
 
374 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  38.33 
 
 
371 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  41.6 
 
 
385 aa  215  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  36.47 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  37.54 
 
 
375 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  35.98 
 
 
376 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  35.98 
 
 
376 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  35.98 
 
 
376 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  36.24 
 
 
418 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  42.55 
 
 
272 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  43.04 
 
 
275 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  38.62 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  38.62 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  40.68 
 
 
275 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  33.06 
 
 
410 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  39.92 
 
 
275 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  40.76 
 
 
285 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  40.76 
 
 
274 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  36.71 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  36.29 
 
 
292 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  37.25 
 
 
278 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  39.5 
 
 
274 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  36.97 
 
 
295 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  34.5 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  34.5 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  29.68 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  28.02 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  28.37 
 
 
395 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  27.92 
 
 
396 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  30.62 
 
 
386 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  28.96 
 
 
399 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  33.91 
 
 
228 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  31.72 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  28.01 
 
 
691 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  25.85 
 
 
438 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  23.67 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  22.82 
 
 
702 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  24.03 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.91 
 
 
677 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  26.54 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>