46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0401 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  84.47 
 
 
388 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  88.55 
 
 
377 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  88.55 
 
 
377 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  88.55 
 
 
377 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  46.93 
 
 
359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  41.73 
 
 
404 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  40.1 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  40.1 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  40.1 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  38.15 
 
 
479 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  35.14 
 
 
435 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  39.49 
 
 
401 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  39.3 
 
 
416 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  35.91 
 
 
431 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  34.9 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  30.43 
 
 
448 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  31.94 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  30.82 
 
 
528 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  29.34 
 
 
588 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  29.92 
 
 
655 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  28.88 
 
 
580 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.46 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
469 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  33.12 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  28.65 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  27.57 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  26.32 
 
 
494 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  27.88 
 
 
458 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  26.44 
 
 
540 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  27.23 
 
 
783 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  30.1 
 
 
768 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  32.17 
 
 
517 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  28.57 
 
 
499 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  32.17 
 
 
517 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  32.17 
 
 
517 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  32.74 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  32.74 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  27.94 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  26.91 
 
 
533 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  28.7 
 
 
396 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  27.27 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  24.49 
 
 
542 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  24.49 
 
 
542 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  24.49 
 
 
542 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>