28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl541 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl541  16S rRNA processing protein  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000678449  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0546  16S rRNA processing protein RimM, putative  40.61 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  28.24 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  29.24 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  26.19 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  27.54 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  28.4 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  28.4 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  24.56 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  27.91 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  28.4 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  26.79 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  26.79 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  24.1 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1474  16S rRNA-processing protein RimM  24.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  24.26 
 
 		 166 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  26.16 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2869  16S rRNA processing protein RimM  22.09 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257467  hitchhiker  0.000000637329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>