More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4541 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 340 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  688    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.18 
 
 		 340 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  84.12 
 
 		 340 aa  593  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  86.47 
 
 		 340 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  85 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.64 
 
 		 340 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.41 
 
 		 340 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  68.82 
 
 		 340 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.04 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  68.04 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.74 
 
 		 342 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.44 
 
 		 342 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  69.23 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.23 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.74 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.16 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  67.16 
 
 		 342 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  65.4 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  62.17 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.72 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.1 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.44 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.16 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.76 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.06 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 327 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.9 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.12 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 324 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.34 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.22 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.5 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  36.96 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  34 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.45 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.64 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  35.19 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.49 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.16 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.94 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  33.62 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.47 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.84 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  33.95 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  34.45 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  34.94 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.63 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>