51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1798 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  98.56 
 
 		 208 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  93.75 
 
 		 220 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  75.96 
 
 		 208 aa  274  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  74.4 
 
 		 207 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  80.88 
 
 		 213 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  60.4 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  57.97 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  47.29 
 
 		 518 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  44.28 
 
 		 555 aa  175  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  43.2 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  46.74 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.27 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  43.22 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  39.81 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  42.42 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  48.95 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  40.64 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.32 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.61 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.22 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.69 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.76 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  40.76 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  47.78 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.7 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.76 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.41 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.9 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  40.54 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.97 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.37 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  33.69 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  41.44 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  38.5 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  38.5 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.88 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.88 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  47.87 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  36.47 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.96 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  39.77 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.31 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2518  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  36.29 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1567  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.29 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  27.68 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.96 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  34.51 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  29.29 
 
 		 490 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>