48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1032 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  706    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  73.91 
 
 
349 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  72.75 
 
 
349 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  71.59 
 
 
349 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  48.18 
 
 
414 aa  329  4e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  25.42 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.79 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.06 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  22.5 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.89 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  22.95 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  23.1 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  20 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  20.79 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  21.45 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  37.4 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  36.04 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  26.89 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  25.56 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  34.21 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  31.69 
 
 
311 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  19.33 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  28.22 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  23.36 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  24.52 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  22.44 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.56 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.56 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.11 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  26.35 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  24.24 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.28 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  26.44 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.41 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  19.51 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  23.36 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  24.19 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  24.19 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  22.04 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  25.43 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0226  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.86 
 
 
1102 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  24.19 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2611  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  19.63 
 
 
1056 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42572  Carbamoyl-phosphate synthase L chain  25.64 
 
 
1105 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0674343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  28.74 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  25.45 
 
 
295 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>