103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4106 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  70.33 
 
 		 188 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  69.23 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  48.89 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  48.89 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  48.89 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  48.89 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  48.89 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  53.49 
 
 		 189 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  53.49 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  52.33 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  51.65 
 
 		 232 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  50.57 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  49.45 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  49.45 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  47.25 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  54.43 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  47.25 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  45.65 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  54.17 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  52.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  52.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  52.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  50.57 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  46.15 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  41.57 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  54.79 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  44.32 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  44.32 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  47.25 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  49.33 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  52.7 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  48.1 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  44.44 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  39.24 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  51.39 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  41.11 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  42.22 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  42.17 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  46.05 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  38.71 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  39.76 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  39.76 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  40.26 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  42.22 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  37.08 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  37.08 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  39.13 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  36.17 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  43.06 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  44.44 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  32.22 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  45.71 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  35.48 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  39.47 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  36.76 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000676254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  39.74 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  34.62 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  36.59 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  38.89 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  34.15 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  43.28 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  34.88 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  37.18 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  40 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  36.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  42.67 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  31.17 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  31.17 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  35.48 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17940  predicted membrane protein  42.25 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  32.14 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  37.18 
 
 		 193 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3845  hypothetical protein  29.76 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000297059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  29.87 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  28.57 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  29.87 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  29.87 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  33.33 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.992365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>