29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2278 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  244  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  55.21 
 
 
121 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  46.91 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.64 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  43.21 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.77 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  32.94 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.53 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  30.38 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  39.68 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  31.03 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  42.86 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  35.63 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  31.52 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3081  hypothetical protein  69.23 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  31.52 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  36.26 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  37.97 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>