27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0552 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  82.45 
 
 		 307 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  38.83 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  36.92 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  39.11 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  36.11 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  33.58 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.42 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  32.84 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  32.84 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  32.84 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  25.49 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  33.88 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  32.8 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  30.97 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  27.97 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  22.73 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  34.69 
 
 		 394 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32.08 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  26.91 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  25.28 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.95 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  32.61 
 
 		 147 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  24.48 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>