49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0040 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0010  tRNA-Val  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    96.55 
 
 		 364 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    96.43 
 
 		 380 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20650  tRNA-Val  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0569  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    96.15 
 
 		 364 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.844027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    96.15 
 
 		 360 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0019  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.964616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>