22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0144 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  727    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  25.84 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.57 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  25.58 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  25.63 
 
 
491 aa  79.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  30.05 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.01 
 
 
626 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  26.1 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  23.78 
 
 
840 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  24.53 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  26.24 
 
 
629 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  25.2 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  25.77 
 
 
258 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  23.27 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  23.43 
 
 
553 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  23.08 
 
 
559 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.43 
 
 
870 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.26 
 
 
528 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  25.48 
 
 
425 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  24.72 
 
 
200 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  28.07 
 
 
405 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  21.81 
 
 
432 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>