30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1831 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 135 aa  259  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  259  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  97.56 
 
 		 138 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  65.93 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  67.97 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  67.44 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  54.14 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  38.52 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  35.58 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.84 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  34.92 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  34.92 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  29.46 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  38.37 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  32.03 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  31.16 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  33.6 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  30.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  29.75 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  27.56 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  29.46 
 
 		 138 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>