More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1227 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  75.42 
 
 
424 aa  666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
422 aa  864    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.28 
 
 
429 aa  553  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.69 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0982  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.78 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.272083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2560  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.7 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0525  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.59 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0303204  normal  0.794843 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1235  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.74 
 
 
413 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0633265  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.29 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.53 
 
 
427 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.29 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.47 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.8 
 
 
432 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.39 
 
 
427 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.61 
 
 
426 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.16 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.99 
 
 
427 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.65 
 
 
430 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.13 
 
 
432 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.52 
 
 
432 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.65 
 
 
426 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.02 
 
 
430 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.41 
 
 
426 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
426 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.62 
 
 
427 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.84 
 
 
426 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.54 
 
 
428 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  44.98 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.49 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.41 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.73 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.5 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.04 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.46 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  44.98 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.18 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.5 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.36 
 
 
429 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
431 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.76 
 
 
430 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
426 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
430 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0490  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.32 
 
 
424 aa  398  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.43 
 
 
426 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.22 
 
 
430 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.62 
 
 
429 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.45 
 
 
430 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.06 
 
 
626 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.35 
 
 
428 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.99 
 
 
431 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.78 
 
 
425 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
426 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
445 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  44.52 
 
 
437 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
429 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
428 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.69 
 
 
430 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
430 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.43 
 
 
431 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
432 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.46 
 
 
429 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1280  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  44.58 
 
 
434 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.542445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.17 
 
 
427 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.46 
 
 
428 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.02 
 
 
428 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.14 
 
 
427 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.22 
 
 
432 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  43.29 
 
 
427 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.22 
 
 
429 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.03 
 
 
432 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.11 
 
 
433 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.45 
 
 
430 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.93 
 
 
427 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.89 
 
 
431 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.98 
 
 
430 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.32 
 
 
428 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.75 
 
 
433 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.74 
 
 
430 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.41 
 
 
428 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.17 
 
 
429 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.67 
 
 
432 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.73 
 
 
429 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.22 
 
 
429 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.27 
 
 
453 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  43.37 
 
 
428 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.93 
 
 
429 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.97 
 
 
429 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>