19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0481 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  331  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 
398 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 
398 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  26.71 
 
 
291 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 
1348 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  26.32 
 
 
360 aa  48.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  29.03 
 
 
598 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  22.68 
 
 
272 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 
1656 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  26.15 
 
 
566 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.62 
 
 
1373 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  24.83 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  33.33 
 
 
2159 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  30.61 
 
 
796 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  26.26 
 
 
290 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  22.9 
 
 
586 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  26.88 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 
1363 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  23.08 
 
 
441 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>