More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2418 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
940 aa  1909    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.92 
 
 
278 aa  173  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.59 
 
 
604 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  43.41 
 
 
627 aa  160  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.99 
 
 
282 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.13 
 
 
645 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.59 
 
 
358 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 
284 aa  154  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  37.98 
 
 
287 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.29 
 
 
280 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.52 
 
 
309 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  37.63 
 
 
287 aa  152  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  40.47 
 
 
649 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.79 
 
 
646 aa  152  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
364 aa  152  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.71 
 
 
281 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
289 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.68 
 
 
280 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15201  putative phosphate ABC transporter  35.89 
 
 
306 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.84 
 
 
288 aa  148  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.04 
 
 
274 aa  148  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
274 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  33.1 
 
 
291 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.18 
 
 
295 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.31 
 
 
294 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
288 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  35.77 
 
 
291 aa  145  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  32.41 
 
 
367 aa  145  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.29 
 
 
309 aa  145  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  37.5 
 
 
281 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 
283 aa  144  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.05 
 
 
291 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.85 
 
 
294 aa  144  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  34.98 
 
 
296 aa  144  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
278 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.39 
 
 
294 aa  142  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.13 
 
 
293 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.47 
 
 
283 aa  141  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  36.52 
 
 
297 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.21 
 
 
283 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.15 
 
 
288 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  31.93 
 
 
295 aa  139  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.68 
 
 
284 aa  140  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4001  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.93 
 
 
296 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.8 
 
 
283 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.17 
 
 
289 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.68 
 
 
322 aa  140  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.63 
 
 
362 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  32.42 
 
 
296 aa  139  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.91 
 
 
288 aa  138  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.72 
 
 
354 aa  139  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.6 
 
 
284 aa  138  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  41.27 
 
 
283 aa  138  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.83 
 
 
296 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.78 
 
 
295 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.83 
 
 
296 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.83 
 
 
296 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.28 
 
 
295 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  31.53 
 
 
361 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  34.27 
 
 
277 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.28 
 
 
295 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.55 
 
 
293 aa  137  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.83 
 
 
296 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.83 
 
 
296 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08641  putative phosphate ABC transporter  34.62 
 
 
297 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.53 
 
 
288 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.28 
 
 
295 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.56 
 
 
304 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  31.49 
 
 
297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.86 
 
 
306 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  31.29 
 
 
294 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.96 
 
 
295 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.52 
 
 
295 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.27 
 
 
282 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.73 
 
 
301 aa  135  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.73 
 
 
301 aa  135  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  31.49 
 
 
296 aa  134  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  28.71 
 
 
383 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33 
 
 
370 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.26 
 
 
294 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.49 
 
 
296 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  31.99 
 
 
293 aa  134  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.49 
 
 
296 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.08 
 
 
359 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.4 
 
 
280 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.96 
 
 
312 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.4 
 
 
280 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.9 
 
 
287 aa  132  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.89 
 
 
292 aa  132  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.56 
 
 
369 aa  132  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1988  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  31.82 
 
 
291 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.64 
 
 
305 aa  131  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.64 
 
 
305 aa  131  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.68 
 
 
295 aa  131  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>