More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0839 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 
309 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  63.91 
 
 
303 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  61.06 
 
 
305 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
302 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  59.47 
 
 
302 aa  368  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  58.75 
 
 
309 aa  364  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 
301 aa  359  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 
305 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
303 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  56.54 
 
 
306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
303 aa  351  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
307 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
315 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  55.63 
 
 
305 aa  338  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
302 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 
323 aa  332  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  53.26 
 
 
305 aa  331  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 
312 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
314 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 
300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
312 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
302 aa  325  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  52.68 
 
 
309 aa  323  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
320 aa  322  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
309 aa  319  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
313 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
303 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
316 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 
301 aa  311  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
316 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
316 aa  310  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
316 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 
303 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
297 aa  309  4e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  52.2 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  305  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  51.86 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 
299 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.66 
 
 
308 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
309 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
308 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
311 aa  299  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
309 aa  299  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
305 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
306 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
298 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
304 aa  297  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
296 aa  296  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
306 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 
312 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
304 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
306 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  46.44 
 
 
298 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
302 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
306 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
312 aa  292  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
312 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
312 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 
308 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
329 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>