162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1692 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1692  prenyltransferase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2419  prenyltransferase  55.15 
 
 
313 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.98 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.36 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.76 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.65 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.32 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.6 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.45 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.94 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.9 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  26.01 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0482  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.26 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.398255  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.17 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.86 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.41 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.51 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.13 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  26.83 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.35 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.46 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.78 
 
 
299 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.75 
 
 
334 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.17 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.22 
 
 
286 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.5 
 
 
286 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.67 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  27.08 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.04 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.14 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.54 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.03 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.23 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.1 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  21.6 
 
 
622 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.44 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.13 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3469  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.91 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  0.729322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.91 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.39 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.78 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1336  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.4 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.55 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  24.36 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.64 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.32 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.67 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.67 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.01 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.77 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.05 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.23 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.88 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.23 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.23 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  23.89 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  26.18 
 
 
302 aa  47  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  24.76 
 
 
423 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.16 
 
 
296 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.38 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.17 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  28.24 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.78 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.68 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.22 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.7 
 
 
285 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  26.18 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.75 
 
 
299 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05191  prenyltransferase  24.88 
 
 
295 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.659652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.11 
 
 
310 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.62 
 
 
304 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.88 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  25 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.91 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.54 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.89 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2438  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.54 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.53 
 
 
287 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.27 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.34 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.91 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>