50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2419 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2419  prenyltransferase  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1692  prenyltransferase  55.52 
 
 		 297 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0482  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.91 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.398255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  24.8 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  31.06 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  31.48 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  29.87 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.68 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.22 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  25 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  32.48 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.9 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  25 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  32.93 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1980  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.32 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.91 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  38.2 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  29.91 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  27.85 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  27.04 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  26.79 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  24.88 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  25.38 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.08 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  25.21 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  27.22 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  26.11 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  26.11 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  26.92 
 
 		 622 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  26.11 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  26.11 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  25.21 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  26.91 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  26.47 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.4 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  26.11 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.27 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.22 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  27.16 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  26.75 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.1 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  25.56 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  26.05 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  24.62 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.14 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  30.18 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  30.18 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  24.58 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>