164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0703 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0703  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  841    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.631439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1906  CoA enzyme activase  78.31 
 
 
414 aa  671    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.213547  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  68.55 
 
 
408 aa  586  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2061  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  68.97 
 
 
412 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0251  methanogenesis marker protein 15  69.53 
 
 
413 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.447207  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  68.06 
 
 
417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2307  CoA enzyme activase  68.55 
 
 
413 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0551  NADPH-dependent F420 reductase  66.18 
 
 
420 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.134665 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0998  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  62.62 
 
 
411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1630  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  62.62 
 
 
411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.308559  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0284  methanogenesis marker protein 15  62.13 
 
 
411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1480  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  61.88 
 
 
413 aa  512  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1109  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  61.39 
 
 
410 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.84 
 
 
539 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  36.47 
 
 
255 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.6 
 
 
263 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
347 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.49 
 
 
539 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.98 
 
 
336 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  31.91 
 
 
1354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.1 
 
 
1021 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.17 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.46 
 
 
262 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.78 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.77 
 
 
330 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.79 
 
 
269 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  33.21 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.9 
 
 
1415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.85 
 
 
250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.72 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.57 
 
 
268 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  32.95 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.07 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.95 
 
 
1415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.64 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  29.28 
 
 
320 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.52 
 
 
259 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.96 
 
 
344 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.22 
 
 
331 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  32.82 
 
 
259 aa  113  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.57 
 
 
267 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.15 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.47 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.59 
 
 
256 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.18 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.16 
 
 
259 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.42 
 
 
264 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  31.66 
 
 
258 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.03 
 
 
263 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  29.43 
 
 
319 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.12 
 
 
260 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.38 
 
 
329 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  29.85 
 
 
320 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.14 
 
 
255 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.92 
 
 
269 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.89 
 
 
327 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  32.31 
 
 
249 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  30.92 
 
 
256 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.2 
 
 
274 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  28.19 
 
 
283 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  32.43 
 
 
268 aa  104  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.9 
 
 
1343 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  28.19 
 
 
283 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  31.76 
 
 
339 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.48 
 
 
329 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.47 
 
 
1036 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.34 
 
 
319 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  32.5 
 
 
256 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.77 
 
 
272 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.16 
 
 
253 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  32.28 
 
 
259 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.23 
 
 
283 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.38 
 
 
272 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.29 
 
 
264 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.63 
 
 
267 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.98 
 
 
255 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.65 
 
 
261 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.54 
 
 
269 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.07 
 
 
320 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.92 
 
 
1500 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.42 
 
 
249 aa  96.3  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.3 
 
 
267 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.66 
 
 
1461 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  30.59 
 
 
255 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  30.59 
 
 
255 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  30.71 
 
 
247 aa  95.5  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.59 
 
 
255 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.2 
 
 
255 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.59 
 
 
255 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.59 
 
 
255 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.59 
 
 
255 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.3 
 
 
251 aa  94.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  30.57 
 
 
1647 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.73 
 
 
323 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  31.13 
 
 
248 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.01 
 
 
1415 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.95 
 
 
1411 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  29.06 
 
 
1503 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.34 
 
 
324 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>