299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0051 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  95.45 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  94.83 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0050  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.124886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0020  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0068  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0493446  normal  0.903824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t41  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.821705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0043  tRNA-Gln  95.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150748  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>