15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2398 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.03 
 
 		 1107 aa  62.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 772 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  27.06 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  26.1 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  24.73 
 
 		 956 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  24.88 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  28.12 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 508 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  32.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 504 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  27.71 
 
 		 611 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  26.17 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  24.4 
 
 		 743 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  26.9 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>