169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2275 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.41 
 
 
264 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  42.56 
 
 
244 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  44.17 
 
 
238 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.48 
 
 
242 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  40.25 
 
 
241 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.42 
 
 
242 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.81 
 
 
241 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.91 
 
 
242 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.35 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.59 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.19 
 
 
241 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.19 
 
 
241 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.27 
 
 
247 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.19 
 
 
241 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.41 
 
 
260 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.19 
 
 
241 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.82 
 
 
247 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.51 
 
 
242 aa  175  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.55 
 
 
253 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.6 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.08 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.08 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.6 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.68 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.29 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  39.91 
 
 
243 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.25 
 
 
261 aa  171  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  37.34 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.66 
 
 
241 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.91 
 
 
241 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.66 
 
 
242 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.39 
 
 
246 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  40.87 
 
 
245 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.23 
 
 
241 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.35 
 
 
251 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.16 
 
 
251 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  41.55 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  38.07 
 
 
245 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  36.8 
 
 
285 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  39.81 
 
 
258 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.29 
 
 
210 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  35.93 
 
 
285 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  38.86 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.93 
 
 
237 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 
236 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  36.36 
 
 
236 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 
236 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 
236 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  36.36 
 
 
236 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  36.36 
 
 
236 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 
236 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  37.79 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  36.97 
 
 
262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  36.97 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.93 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.65 
 
 
238 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  34.47 
 
 
254 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.93 
 
 
262 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.17 
 
 
264 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.29 
 
 
237 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.29 
 
 
237 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.29 
 
 
237 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.23 
 
 
238 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.29 
 
 
237 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.29 
 
 
237 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  38.46 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.22 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  34.5 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.39 
 
 
237 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.92 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.77 
 
 
239 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.45 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  34.09 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.87 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.87 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.87 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  29.68 
 
 
249 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.95 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.98 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  31.39 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.58 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  35.9 
 
 
179 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.23 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  35.88 
 
 
187 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.33 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  28.32 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  27.13 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  30.22 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  25.21 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.83 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.83 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  32.75 
 
 
371 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  29.12 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.19 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  27.76 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  28.18 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>