133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0032 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  93.95 
 
 
361 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  723    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  55.05 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  30.74 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  33.76 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  28.98 
 
 
285 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.81 
 
 
238 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.81 
 
 
238 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.81 
 
 
238 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.06 
 
 
247 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  30.67 
 
 
246 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  28.86 
 
 
243 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.83 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.45 
 
 
247 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.7 
 
 
236 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  33.9 
 
 
236 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  33.9 
 
 
236 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  33.9 
 
 
236 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  32.97 
 
 
238 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.28 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.67 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.67 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.24 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.96 
 
 
238 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  29.12 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.86 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.86 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.86 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.76 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.86 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.86 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.8 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.35 
 
 
237 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.31 
 
 
242 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.05 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.66 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.59 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.22 
 
 
261 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.27 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.47 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.9 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  31.79 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.98 
 
 
251 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.87 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.84 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.81 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.17 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  26.38 
 
 
244 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  23.96 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.42 
 
 
241 aa  67  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.71 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.58 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  28 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.08 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.09 
 
 
262 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.75 
 
 
242 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  28.31 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.23 
 
 
250 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.17 
 
 
240 aa  63.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  28.28 
 
 
178 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  33.33 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  26.6 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  31.68 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  31.3 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.98 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  24.39 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  26.7 
 
 
232 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  33.98 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  28.57 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
245 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  34.26 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.92 
 
 
245 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  34.94 
 
 
179 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  37.14 
 
 
236 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.14 
 
 
236 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  30.05 
 
 
235 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>