156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0996 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  264  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  60.98 
 
 
128 aa  153  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  59.66 
 
 
127 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  57.98 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  57.14 
 
 
127 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  36.73 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  35.63 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  36.26 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  34.88 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  39.33 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  32.95 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  36.05 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  34.88 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  33.72 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  33.72 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  33.72 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  34.52 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  34.52 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  31.03 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0809  hypothetical protein  34.41 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  35.63 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3398  hypothetical protein  37.08 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  decreased coverage  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3570  hypothetical protein  35.96 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000605463  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  35.63 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  32.35 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  31.4 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0981  hypothetical protein  37.21 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000254887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  35.96 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  28.3 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  31.03 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  34.48 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  31.03 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  37.97 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  34.48 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0998  hypothetical protein  38.37 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0952  RNA-binding protein  34.83 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000959457  normal  0.423674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0180  protein of unknown function UPF0044  34.83 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1015  hypothetical protein  33.71 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  32.04 
 
 
96 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1195  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  34.88 
 
 
94 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1017  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00654366  hitchhiker  0.00428084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1082  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0287307  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1021  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000882281  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3248  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000511442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2843  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000290881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3290  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  35.96 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1119  protein of unknown function UPF0044  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0127613  hitchhiker  0.0000000000583133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3426  hypothetical protein  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000346407  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3700  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002601  RNA binding protein  34.83 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00022914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  32.56 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2737  hypothetical protein  27.17 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2358  protein of unknown function UPF0044  27.17 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.496102  hitchhiker  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  29.9 
 
 
175 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1569  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000968018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  31.65 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0852  protein of unknown function UPF0044  33.71 
 
 
208 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0272  protein of unknown function UPF0044  29.41 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  31.4 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  28.75 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2190  hypothetical protein  29.17 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0303198  normal  0.0370255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0283  protein of unknown function UPF0044  29.41 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  34.29 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0700  protein of unknown function UPF0044  34.09 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2172  hypothetical protein  28.28 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  32.56 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1260  hypothetical protein  31.82 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  34.07 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>