More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0693 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  89.32 
 
 		 281 aa  522  1e-147  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  68.35 
 
 		 281 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  66.19 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  67.26 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  67.26 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  66.43 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  64.77 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  65 
 
 		 276 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  66.43 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  66.43 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  64.41 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  66.43 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  65.12 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  64.77 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  63.67 
 
 		 278 aa  363  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  61.21 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  62.14 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  61.43 
 
 		 276 aa  349  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 275 aa  341  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  60 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  60.79 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 287 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 287 aa  332  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 275 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  58.21 
 
 		 277 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 		 275 aa  328  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  56.79 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  57.65 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  56.43 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  58.36 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  56.43 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  59.43 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  56.43 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  56.79 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  55.36 
 
 		 287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.43 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  56 
 
 		 287 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  55.64 
 
 		 287 aa  314  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  56 
 
 		 287 aa  314  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  54.45 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  59.79 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  55.64 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  55.36 
 
 		 275 aa  311  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.52 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  55.67 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  55.71 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  55 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  56.07 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  58.51 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000124196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  57.5 
 
 		 273 aa  302  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 278 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  52.86 
 
 		 283 aa  301  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  56.94 
 
 		 274 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  57.86 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  56.94 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  55.4 
 
 		 273 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  56.94 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  56.94 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  55.4 
 
 		 273 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  56.18 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  55.71 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  54.8 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  58.51 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  54.09 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  56.79 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>