183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0688 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 138 aa  272  9e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  58.99 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  36.14 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.75 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  51.85 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  40.98 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  42.67 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  44.78 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  46 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  44.64 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  42.25 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  42.03 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  45.1 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  39.13 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  40.3 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  44 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  45.28 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  40.85 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  35.59 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  40.38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  47.17 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  47.17 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  44 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>