280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0478 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  55.35 
 
 
256 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  49.57 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  54.88 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  54.88 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  54.93 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  54.93 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  54.93 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  54.93 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  54.93 
 
 
259 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  54.33 
 
 
215 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  52.31 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  53.52 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  44.34 
 
 
243 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  48.36 
 
 
221 aa  203  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  49.55 
 
 
233 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  52.51 
 
 
218 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  52.51 
 
 
218 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  45.21 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  51.42 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  51.6 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  51.4 
 
 
242 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  52.51 
 
 
218 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  52.05 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  44.98 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  52.05 
 
 
218 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  52.05 
 
 
218 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  49.55 
 
 
240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  49.55 
 
 
253 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  43.86 
 
 
237 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  53.05 
 
 
217 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  44.74 
 
 
237 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  44.3 
 
 
237 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  50.74 
 
 
215 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  51.47 
 
 
215 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  43.42 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  44.3 
 
 
237 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  44.69 
 
 
242 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  50.98 
 
 
215 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  46.19 
 
 
249 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  47.71 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  49.05 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  47.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  47.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  47.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  53.76 
 
 
216 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  47.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  47.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 
218 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  53.76 
 
 
216 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  44.89 
 
 
243 aa  185  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  46.83 
 
 
219 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  42.54 
 
 
233 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  47.8 
 
 
218 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  47.56 
 
 
244 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  45.98 
 
 
243 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  46.34 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  46.12 
 
 
218 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  46.34 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  46.34 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  46.34 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  46.34 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  47.09 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  46.34 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  46.34 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  42.79 
 
 
244 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.09 
 
 
241 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  38.6 
 
 
244 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  38.6 
 
 
244 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  40.37 
 
 
234 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  45.19 
 
 
218 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  45.85 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  47.64 
 
 
218 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  46.83 
 
 
218 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  42.48 
 
 
242 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  44.29 
 
 
227 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  47.75 
 
 
241 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  44.3 
 
 
249 aa  174  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  44.02 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  48.4 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  45.24 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  45.24 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  49.32 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  45.24 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  41.55 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  38.64 
 
 
243 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 
226 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  40.85 
 
 
231 aa  167  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  41.01 
 
 
246 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  41.28 
 
 
246 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  45.91 
 
 
244 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  46.05 
 
 
221 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  42.99 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  46.36 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  51.1 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>