More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0206 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  100 
 
 
127 aa  247  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.33 
 
 
134 aa  127  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  61.76 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  52.89 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  61.76 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.07 
 
 
136 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  56.76 
 
 
118 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  58.56 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.13 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.73 
 
 
118 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  55.65 
 
 
118 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  52.25 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.61 
 
 
132 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.61 
 
 
132 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
111 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
111 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  39.42 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  39.42 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  39.45 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.71 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.36 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  34.91 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  33.02 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  32.38 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.55 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.96 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  33.33 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.58 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  32.71 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  31.78 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.37 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.03 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.91 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  33.33 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.47 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.08 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.65 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.65 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.14 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  33.33 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.41 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.08 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.65 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  32.71 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3082  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.9 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0030958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  32.71 
 
 
168 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.41 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  37.8 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.28 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.13 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.02 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  30.56 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.03 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  36.59 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  33.04 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  29.63 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  30.19 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  35.37 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2945  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.9 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.29 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  35.29 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  32.08 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  35.29 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  30.56 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  36.59 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.47 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.12 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.59 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.59 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.12 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.04 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  33.64 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.12 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  29.63 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.29 
 
 
119 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  34.12 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.59 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  32.69 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.56 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.73 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.59 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.86 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>