84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03355 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  100 
 
 		 666 aa  1370    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  32.04 
 
 		 658 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  26.59 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  26.86 
 
 		 634 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  26.91 
 
 		 634 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  27.87 
 
 		 677 aa  174  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  26.63 
 
 		 634 aa  173  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  26.65 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.34 
 
 		 634 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.34 
 
 		 634 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  29.76 
 
 		 603 aa  170  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  25.34 
 
 		 721 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  27.38 
 
 		 627 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  26.74 
 
 		 628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  25.57 
 
 		 624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  27.96 
 
 		 661 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  28.57 
 
 		 555 aa  165  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  26.19 
 
 		 619 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  27.08 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 653 aa  161  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  26.58 
 
 		 627 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  26.67 
 
 		 602 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  25.64 
 
 		 607 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 604 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.62 
 
 		 616 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  26.1 
 
 		 603 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  24.92 
 
 		 595 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 604 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  25.94 
 
 		 604 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  25.11 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  25.53 
 
 		 604 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  23.38 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  26.28 
 
 		 629 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  26.01 
 
 		 605 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  26.13 
 
 		 605 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  23.68 
 
 		 617 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  25.76 
 
 		 605 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  24.38 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  26.25 
 
 		 635 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  24.68 
 
 		 394 aa  117  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  24.68 
 
 		 396 aa  117  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  23.8 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  25 
 
 		 625 aa  112  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  23.72 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  22.1 
 
 		 672 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  24.75 
 
 		 628 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  23.14 
 
 		 604 aa  97.8  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  20.85 
 
 		 678 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  20.58 
 
 		 678 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  23.19 
 
 		 672 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  23.06 
 
 		 678 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  23.06 
 
 		 678 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  23.06 
 
 		 678 aa  94.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  22.88 
 
 		 678 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  20.51 
 
 		 678 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  22.88 
 
 		 678 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  22.65 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  26.05 
 
 		 680 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  25.08 
 
 		 682 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  25.58 
 
 		 573 aa  88.6  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  20.78 
 
 		 680 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  20.6 
 
 		 680 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  26.08 
 
 		 576 aa  87  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  20.26 
 
 		 680 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  24.33 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  20.25 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  22.28 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  20.93 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  20.93 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  22.56 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  23 
 
 		 621 aa  81.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  23.78 
 
 		 603 aa  80.9  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  21.3 
 
 		 617 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  21.83 
 
 		 689 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  20.61 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  25.97 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  25.79 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  24.75 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  23.8 
 
 		 525 aa  56.2  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  21.87 
 
 		 612 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  21.87 
 
 		 612 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  22.82 
 
 		 510 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  44.19 
 
 		 417 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  19.63 
 
 		 481 aa  43.9  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>