33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02777 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02777  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4907  hypothetical protein  39.76 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0355  hypothetical protein  40.41 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4152  hypothetical protein  35.68 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  34.27 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1251  hypothetical protein  38.51 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4327  hypothetical protein  36.15 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.705923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3959  hypothetical protein  44.17 
 
 		 200 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0348068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1875  putative inner membrane protein  40.6 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.843828  normal  0.555208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0783  hypothetical protein  35.97 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4922  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8434  protein of unknown function DUF417  37.76 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0120  hypothetical protein  37.01 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.602554  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4429  hypothetical protein  38.28 
 
 		 158 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.190357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1189  hypothetical protein  36.21 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5423  protein of unknown function DUF417  35.77 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5456  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0118  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3630  hypothetical protein  48.44 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1526  membrane protein  40.52 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  30.43 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2211  protein of unknown function DUF417  29.48 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510036  normal  0.18844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5270  protein of unknown function DUF417  57.14 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  normal  0.0500775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1294  hypothetical protein  40.38 
 
 		 191 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0133647  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3319  hypothetical protein  23.67 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00262  hypothetical protein  23.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3302  protein of unknown function DUF417  23.67 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0315  hypothetical protein  23.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0355  hypothetical protein  23.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00258  conserved inner membrane protein  23.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0354  hypothetical protein  23.53 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735666 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1609  protein of unknown function DUF417  40.82 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.22956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0334  hypothetical protein  22.94 
 
 		 197 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>