41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4327 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4327  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  332  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.705923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0118  hypothetical protein  67.13 
 
 
149 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3959  hypothetical protein  43.71 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0348068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0783  hypothetical protein  48.85 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0120  hypothetical protein  49.57 
 
 
164 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.602554  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8434  protein of unknown function DUF417  47.83 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1875  putative inner membrane protein  45.86 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.843828  normal  0.555208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  38.22 
 
 
186 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5423  protein of unknown function DUF417  46.09 
 
 
158 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5456  hypothetical protein  46.09 
 
 
158 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4429  hypothetical protein  37.34 
 
 
158 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.190357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1189  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4922  hypothetical protein  37.93 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1251  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1526  membrane protein  36 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3630  hypothetical protein  37.58 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0355  hypothetical protein  37.01 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4446  hypothetical protein  30.69 
 
 
207 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128792  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  38.89 
 
 
295 aa  80.5  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4907  hypothetical protein  34.85 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02777  hypothetical protein  36.15 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1271  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709898  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0354  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.735666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0334  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3302  protein of unknown function DUF417  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3319  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00262  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00258  conserved inner membrane protein  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0315  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0355  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0677  hypothetical protein  32.16 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36318  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0667  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0618  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.525105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0733  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0611  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4152  hypothetical protein  34.09 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5270  protein of unknown function DUF417  31.25 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  normal  0.0500775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1294  hypothetical protein  28.49 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0133647  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2211  protein of unknown function DUF417  31.06 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510036  normal  0.18844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1609  protein of unknown function DUF417  28.65 
 
 
209 aa  58.2  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.22956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2126  protein of unknown function DUF417  28.28 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>