38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4922 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4922  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1189  hypothetical protein  66.91 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4429  hypothetical protein  56.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.190357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1526  membrane protein  63.24 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1251  hypothetical protein  55.3 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4327  hypothetical protein  37.93 
 
 		 171 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.705923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  41.79 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0783  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02777  hypothetical protein  38.98 
 
 		 292 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2126  protein of unknown function DUF417  36.15 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0120  hypothetical protein  36.61 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.602554  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1875  putative inner membrane protein  46.43 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.843828  normal  0.555208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3959  hypothetical protein  35.07 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0348068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4907  hypothetical protein  36.44 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5423  protein of unknown function DUF417  35.71 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  32.06 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4152  hypothetical protein  34.88 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0334  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00258  conserved inner membrane protein  30.67 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3302  protein of unknown function DUF417  30.67 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00262  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0315  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0355  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3319  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0354  hypothetical protein  30.06 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735666 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8434  protein of unknown function DUF417  31.25 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3630  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0355  hypothetical protein  34.33 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4446  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1271  hypothetical protein  28.22 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0667  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0618  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.525105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0733  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0611  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0677  hypothetical protein  27.92 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1294  hypothetical protein  28.45 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0133647  normal  0.499874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>