40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1189 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1189  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4429  hypothetical protein  65.03 
 
 		 158 aa  196  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.190357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4922  hypothetical protein  66.91 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1526  membrane protein  61.64 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1251  hypothetical protein  52.55 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.705923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0118  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2126  protein of unknown function DUF417  38.89 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  36.99 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4907  hypothetical protein  36.67 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1875  putative inner membrane protein  43.75 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.843828  normal  0.555208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3630  hypothetical protein  44.72 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0783  hypothetical protein  34.68 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02777  hypothetical protein  36.21 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3959  hypothetical protein  31.71 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0348068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  33.6 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0120  hypothetical protein  32.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.602554  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4152  hypothetical protein  33.05 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5423  protein of unknown function DUF417  32.14 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5456  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4446  hypothetical protein  27.7 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0355  hypothetical protein  32.58 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1271  hypothetical protein  27.7 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709898  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3302  protein of unknown function DUF417  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0334  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3319  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00258  conserved inner membrane protein  28.57 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8434  protein of unknown function DUF417  29.46 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0667  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0618  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.525105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0733  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0611  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0677  hypothetical protein  28.66 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5270  protein of unknown function DUF417  32.77 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  normal  0.0500775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2211  protein of unknown function DUF417  30.46 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510036  normal  0.18844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1294  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0133647  normal  0.499874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>