24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02315 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  267  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  90.15 
 
 
132 aa  247  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  74.24 
 
 
130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  68.94 
 
 
131 aa  187  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  68.94 
 
 
131 aa  184  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  67.42 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  47.66 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  48.12 
 
 
128 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  40.46 
 
 
138 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  41.98 
 
 
137 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  40.6 
 
 
130 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  41.22 
 
 
137 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  41.22 
 
 
137 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  45.05 
 
 
128 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  43.81 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  42.57 
 
 
131 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  38.93 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  42.16 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  41.51 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  37.62 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  28.75 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>