28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01093 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  289  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  61.43 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  56.4 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  54.79 
 
 
146 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  50.7 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  54.35 
 
 
143 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  51.13 
 
 
142 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  50.75 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  53.09 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  49.62 
 
 
143 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  48 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  49.62 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  46.77 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  47.58 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  68.18 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  43.22 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  36.22 
 
 
117 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  38.24 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  48.48 
 
 
136 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  47.3 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  39.36 
 
 
107 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  54.76 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  41.84 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  42.22 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>