More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00680 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  100 
 
 
301 aa  626  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.12 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
323 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  53.14 
 
 
325 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  47.87 
 
 
313 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  46.38 
 
 
326 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
324 aa  258  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
330 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.7 
 
 
304 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  38.28 
 
 
305 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  37.1 
 
 
305 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  36.55 
 
 
305 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  37.76 
 
 
308 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  38.57 
 
 
303 aa  203  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  37.89 
 
 
304 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  36.4 
 
 
305 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  38.49 
 
 
311 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  37.94 
 
 
305 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  37.32 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  39.07 
 
 
296 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.71 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  36.3 
 
 
320 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.71 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.71 
 
 
300 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.71 
 
 
300 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
309 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.71 
 
 
300 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  35.34 
 
 
305 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.01 
 
 
300 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.36 
 
 
300 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
305 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  34.36 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.01 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  35.66 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.01 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  36.03 
 
 
296 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
295 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  34.55 
 
 
296 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
296 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
296 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  31.4 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  33.89 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  35.66 
 
 
298 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  35.48 
 
 
301 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.55 
 
 
307 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  35.25 
 
 
302 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  34.32 
 
 
296 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  34.65 
 
 
296 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  34.65 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  35.25 
 
 
298 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.46 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  35.86 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  35.64 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  33.81 
 
 
302 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  34.45 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  35.76 
 
 
298 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  33.67 
 
 
302 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  35.42 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  34.49 
 
 
298 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  34.49 
 
 
298 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  34.49 
 
 
298 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  34.23 
 
 
298 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  33.92 
 
 
302 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  33.92 
 
 
302 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  34.15 
 
 
298 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
298 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  34.17 
 
 
298 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
298 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
296 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  35.42 
 
 
298 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.19 
 
 
301 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  34.15 
 
 
298 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
283 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  31.25 
 
 
293 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  34.21 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  32.65 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  32.54 
 
 
297 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
290 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
287 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  30.56 
 
 
347 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  32.88 
 
 
304 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0933  aldo/keto reductase  32.65 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.354565  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2743  aldo/keto reductase  31.6 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.991078  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  31.62 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  31.51 
 
 
331 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  30.74 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  30.99 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
325 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.57 
 
 
329 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>