26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6837 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  350  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  83.05 
 
 		 173 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  66.88 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  63.4 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  63.4 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  63.27 
 
 		 164 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  40.6 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  40.6 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  39.85 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  32.18 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  41.04 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  35.33 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  38.52 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  33.54 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  37.78 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  36.76 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  36.76 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  36.03 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  39.57 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  31.76 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  33.85 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.83 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  30.92 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>