26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3991 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  27.51 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  24.74 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  31.16 
 
 
476 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.27 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  24.18 
 
 
241 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  24.21 
 
 
305 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  24.61 
 
 
272 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  25.65 
 
 
442 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  23.81 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  24.47 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  23.56 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  23.28 
 
 
305 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  23.81 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  23.5 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  25.64 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  26.25 
 
 
251 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  25.65 
 
 
211 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  23.37 
 
 
255 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  27.35 
 
 
211 aa  44.7  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  23.08 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  22.63 
 
 
277 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  22.28 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  22.11 
 
 
272 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  26.85 
 
 
223 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>