More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1584 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1584  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00305908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1916  integrase catalytic subunit  78.67 
 
 		 322 aa  356  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1724  integrase catalytic subunit  78.2 
 
 		 322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0153  integrase catalytic subunit  78.2 
 
 		 322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0786  integrase catalytic subunit  78.67 
 
 		 322 aa  354  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1044  integrase catalytic subunit  78.2 
 
 		 322 aa  353  7.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.343683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1002  integrase catalytic subunit  76.78 
 
 		 218 aa  346  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1357  IS30 family transposase  73 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  37.11 
 
 		 321 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 317 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  36.96 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  34.91 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  35.2 
 
 		 356 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  36.41 
 
 		 315 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  35.2 
 
 		 356 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  35.1 
 
 		 386 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  34.36 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  34.36 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  34.36 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  34.36 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 399 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  33.66 
 
 		 399 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  34.69 
 
 		 290 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  34.69 
 
 		 290 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  34.69 
 
 		 290 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  38.26 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  38.26 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  35.57 
 
 		 343 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  37.42 
 
 		 299 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  33.17 
 
 		 347 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  33.17 
 
 		 347 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  33.17 
 
 		 347 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  34.36 
 
 		 335 aa  95.1  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 313 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  34.81 
 
 		 343 aa  95.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 		 251 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  35.16 
 
 		 313 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  36.54 
 
 		 249 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 		 386 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 		 386 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  34.41 
 
 		 273 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  38.78 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  37.58 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  36.77 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.03 
 
 		 342 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  34.25 
 
 		 313 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  36.77 
 
 		 322 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>