More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0353 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0353  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 94 aa  183  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000711109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1763  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000637798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0439  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0408  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157897  normal  0.873484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 94 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 94 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1397  Co-chaperonin GroES (HSP10)  50 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0543716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  52.63 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  51.09 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  48.91 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  46.67 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05480  Co-chaperonin GroES  48.35 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  52.17 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  44.57 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  43.01 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  50 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  44.57 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>