More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0439 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0439  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0408  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157897  normal  0.873484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0353  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000711109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 95 aa  103  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  48.91 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  48.91 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  47.87 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  45.65 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  45.65 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 96 aa  93.2  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 96 aa  93.2  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  43.33 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  51.06 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>