17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1286 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  67.16 
 
 		 376 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 483 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 488 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  35.38 
 
 		 484 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  38.32 
 
 		 483 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 478 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 568 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 		 483 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 572 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 560 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 472 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  28.28 
 
 		 552 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4969  hypothetical protein  40.35 
 
 		 57 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  30.93 
 
 		 470 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 554 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>