96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0316 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  100 
 
 		 612 aa  1239    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  100 
 
 		 612 aa  1239    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  26.13 
 
 		 629 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  27.47 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  27.6 
 
 		 604 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  24.74 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  27.38 
 
 		 596 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  25.71 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  26.3 
 
 		 510 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  27.09 
 
 		 617 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  24.38 
 
 		 635 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  22.63 
 
 		 653 aa  97.8  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  25.31 
 
 		 602 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  25.41 
 
 		 631 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  22.42 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  24.86 
 
 		 396 aa  91.7  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  24.81 
 
 		 607 aa  87.8  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  20.77 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  24.38 
 
 		 604 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  24.59 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  24.17 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  25.79 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  24.85 
 
 		 605 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  25.35 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  24.06 
 
 		 603 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  21.94 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  25.05 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  20.36 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  22.82 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  23.58 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  21.79 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  23.09 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  20.83 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  25.6 
 
 		 573 aa  70.5  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  21.62 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  21.62 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  21.83 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  22.59 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  21.16 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  21.97 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  21.97 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  21.97 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  23.98 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  23.93 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  23.93 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  23.93 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  21.97 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  23.93 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  23.93 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  21.04 
 
 		 603 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  21.87 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  23.25 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  23.25 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  23.12 
 
 		 672 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  25.65 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  20.89 
 
 		 624 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  21.55 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  23.77 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  25.73 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  21.83 
 
 		 721 aa  50.8  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  21.18 
 
 		 680 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  22.4 
 
 		 704 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 400 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 399 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  24.83 
 
 		 403 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 425 aa  47.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  21.02 
 
 		 634 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.76 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  22.7 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  37.29 
 
 		 682 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  24.3 
 
 		 617 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  22.22 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  22.22 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  22.22 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2636  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  22.32 
 
 		 402 aa  44.3  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 399 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 401 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  21.12 
 
 		 634 aa  43.9  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>