31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3042 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  729    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  30.92 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.54 
 
 		 592 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 593 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.82 
 
 		 641 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  26.46 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.39 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 589 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 587 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  26.4 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 606 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 		 610 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  29.57 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  24.56 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  30.26 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  24.32 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  25.09 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 589 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.82 
 
 		 589 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.02 
 
 		 595 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 596 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 574 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 652 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.17 
 
 		 598 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  27.8 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  28.8 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.93 
 
 		 596 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  29.63 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  24.32 
 
 		 480 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>