234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0149 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  100 
 
 
237 aa  447  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  70.53 
 
 
238 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  63.56 
 
 
232 aa  225  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  46.73 
 
 
217 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  43.16 
 
 
269 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  42.51 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  44.62 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  47.37 
 
 
233 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  37.23 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  37.23 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  37.23 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  37.23 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  44.04 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  37.23 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  36.7 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  36.7 
 
 
201 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  37 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  36.17 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  44.44 
 
 
264 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  44.44 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  44.26 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  43.18 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  44.24 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  33.68 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  33.66 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  44.85 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  43.62 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  44.15 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  35.05 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  42.25 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  33.17 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  34.02 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  42.94 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  34.02 
 
 
196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  42.6 
 
 
224 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  30.74 
 
 
234 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  34.02 
 
 
196 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  33.51 
 
 
196 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  43.38 
 
 
176 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  37.79 
 
 
455 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  32.62 
 
 
254 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.02 
 
 
1585 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  29.94 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  29.34 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  29.34 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  29.34 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  28.74 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  28.74 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  28.74 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  28.74 
 
 
290 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  28.74 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  28.74 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.33 
 
 
490 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  33.04 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  32.19 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  37.18 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  32.18 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  30.24 
 
 
865 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  34.36 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  29.38 
 
 
811 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  23.56 
 
 
210 aa  72  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  29.66 
 
 
931 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  30.53 
 
 
474 aa  71.6  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 
1030 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  33.33 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.2 
 
 
1156 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  27.23 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  27.9 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
1021 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.23 
 
 
870 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  28.65 
 
 
1005 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  32.02 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  26.8 
 
 
483 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.8 
 
 
762 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  28 
 
 
711 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  31.11 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.59 
 
 
2413 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  30.36 
 
 
1249 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.55 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  28.92 
 
 
404 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  33.33 
 
 
855 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  30.21 
 
 
494 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  31.63 
 
 
2171 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  31.16 
 
 
4520 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  30.21 
 
 
469 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  31.21 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30.1 
 
 
479 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  27.8 
 
 
954 aa  59.7  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  30.84 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  30.32 
 
 
157 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  29.53 
 
 
161 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  36.63 
 
 
154 aa  58.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.76 
 
 
1402 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  33.5 
 
 
346 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  30.73 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  25 
 
 
723 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  33.04 
 
 
157 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0072  Ankyrin  30.3 
 
 
117 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  31.82 
 
 
395 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
1622 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>