35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1413 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1401  response regulator receiver protein  40.97 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  31.03 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0937  response regulator  33.64 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122555  normal  0.418012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  32.94 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  26.85 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  30.85 
 
 		 108 aa  52  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  22.92 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  23.78 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  33.33 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  25.71 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  29.9 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  29.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.29 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0070  response regulator  31.73 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000561493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 246 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 518 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.19 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  24.56 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  26.88 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  24.49 
 
 		 149 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 247 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 		 249 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  24.49 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.74 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.74 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.74 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.74 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.74 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>