More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1171 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  58.33 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>