More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0789 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  73.02 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  75.89 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  73.91 
 
 		 115 aa  173  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  73.45 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  73.04 
 
 		 115 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  167  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  69.37 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 		 114 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  70.54 
 
 		 114 aa  163  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  69.37 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  67.57 
 
 		 116 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  67.57 
 
 		 116 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  68.47 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 114 aa  153  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 114 aa  150  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  67.29 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  62.73 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  60 
 
 		 113 aa  144  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  63.55 
 
 		 113 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  66.99 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  64.08 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 118 aa  137  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  57.52 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 118 aa  137  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 114 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 116 aa  136  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  59.09 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  56.76 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  57.89 
 
 		 114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  58.88 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  60 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  58.65 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>