52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0463 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0463  competence protein ComGC  100 
 
 
103 aa  206  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  54.46 
 
 
103 aa  104  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1255  competence protein ComGC  62.24 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  36.78 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  33.33 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  33.33 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  30.11 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  30.11 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.1 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  29.03 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  29.03 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  28.89 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  39.66 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  29.03 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  29.03 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  36.84 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2425  competence protein ComGC  43.37 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.402709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  32.35 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  44.9 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  34.43 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  34.57 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  44.9 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
163 aa  42  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  29.31 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  31.65 
 
 
149 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1840  late competence protein, exogenous DNA-binding protein  43.37 
 
 
108 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.63084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  26.23 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  30 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  28.33 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  28.33 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  28.33 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  28.07 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>