22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1708 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  63.41 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  60.62 
 
 
232 aa  198  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  62.59 
 
 
207 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  54.76 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  59.72 
 
 
152 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  61.07 
 
 
144 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  45.14 
 
 
324 aa  118  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  40.45 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  42.94 
 
 
377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  39.01 
 
 
416 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  43.85 
 
 
483 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 
427 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  30.57 
 
 
514 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  32.17 
 
 
815 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
606 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  31.17 
 
 
808 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.23 
 
 
595 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  32.82 
 
 
633 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  27.34 
 
 
643 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.17 
 
 
693 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>